Nature：胰腺癌治疗向全基因组求解
虽然经过了50多年的研究与治疗发展，胰腺癌仍是死亡率极高的癌症，并预计将在十年内位列癌症死亡原因的第二位。胰腺癌的异质性是造成传统治疗方法失效的重要原因。近日，一项由澳大利亚与英国科学家领导的研究对100个胰腺癌基因组进行了深入分析并将其分型。该研究成果有望对胰腺癌患者治疗方案的选取提供依据。这项研究发表在2月25日的Nature杂志上。
来自悉尼Garvan医学研究所的Andrew Biankin教授以及昆士兰大学分子生物学研究所(IMB)的Sean Grimmond教授共同领导了这项研究，并且由来自IMB的生物信息学家Nicola Waddell博士进行了数据的分析工作。该研究团队用以往的检测外显子组(exome)与拷贝数多样性(CNV)的方法分析了100名患者的基因组，结果发现除了少数高频突变外(如KRAS、TP53)，还有成千上万的低频突变基因，形成复杂的突变景观，这是肿瘤异质性产生的原因。“由于这种异质性的存在，无怪乎对癌症患者采用未经选择的治疗方案面临着巨大的挑战，”Biankin教授说，“因此，我们考虑用全基因组测序的方法来作为诊断标准。”
通过全基因组深度测序的方法，研究团队揭示了以往研究中常常忽视的基因组结构变异模式，并根据性质与产生机制将胰腺癌基因组结构变异分成了四个亚型：稳定型、局部重排型、分散型与不稳定型。”通过这些分型，我们能够对每个胰腺癌患者选取特定的目标基因来制定治疗计划。”Biankin教授说。研究小组将该分型方法与病人化疗用药方案如铂等的有效性数据相对比，“将这些数据结合起来，我们可以分析出铂治疗方案有效的基因组类型。”
为了验证该方法的可行性，研究团队还将基因组不稳定型与2013年所报道的一种基于DNA损伤修复基因突变标签的癌症分型方法联系在一起，结果发现损伤修复关键基因BRCA突变标签的出现与不稳定型相一致。“这些验证性数据表明，基因组不稳定性或BCRA突变标签等方法能为胰腺癌临床治疗方案的选择提供线索。”然而Biankin教授也表示，在全基因测序全面投入临床应用之前，仍有很多困难需要克服，如高昂的技术成本以及数据的及时反馈等。
《医学科学报》 (第8期 第11版 国际期刊), 百拇医药